明清交战数年，到此时，凡事比较容易占据的地区，基本都被清军占据。
西线，明军靠着长江，湖湘大地纵横的河流，守住了湖南，东线，赣南、浙西、浙南都是山地丘陵地形，不利于清军作战。
赣南的地形帮助明军，挡住了清军的进攻，不过地形险要之地，往往不太富裕。
现在明军十余万人马，齐聚于赣南小县瑞金，粮食补给全靠从外运输。
浙西、浙南、福建都不是产粮的地方，且运输需要翻山越岭，损耗极大，难以维系。
湖广有粮，不过要穿过湘赣边境的山区，长途运送到赣南，也并不容易，也不划算。
现在大军驻扎瑞金消耗巨大，朱以海见无法将隆武迎入浙江，他也并未强求，毕竟他对此本就有些犹豫，所以见隆武做出决定后，便下令浙军陆续撤离。
赵铭遂即也率领大军，跟随朱以海一起，返回福州，准备瓜分缴获的物资。
在浙军走后，郑成功与郑鸿逵也领兵返回福建，不过如今福建，却已经并非郑家所有，浙系占据福建中部和东部的福州、福宁、延平、建宁、邵武五府，而郑军则控制漳州、泉州、兴化、汀州四府。
浙军和郑军走后，朱聿键在拥唐派大军的簇拥下，离开瑞金，临行前，朱聿键下令，瑞金人口锐减，撤县并入于都县，并令锦衣卫销毁县志。
大军向西行军，三日后抵达赣州，朱聿键依然任命万元吉镇守赣南，不过在将要离开赣南时，朱聿键却做了一个令所有人都意外的举动，并不顾大臣反对，将继承唐王爵位的弟弟朱聿鐭，留在了赣州，并许他监督军务。
自从成祖后，明朝对藩王限制很严，一改太祖朱元璋时对藩王的态度，严厉禁止藩王干政，掌握军队。
朱聿键当初就是因为擅自起兵勤王，被崇祯皇帝知道后，下令削去王爵，关押到凤阳高墙。
不过眼下，天下大乱，宗藩参与起事，掌握军队着并不在少数，朱以海就是藩王起兵，另外湖广蕲黄地区活动的荆王也是拥兵数万抗击清军，成祖以来的规矩，已经被逐渐打破。
面对大臣提醒，防止宗藩做大，朱聿键只是说道：“国难当头，朱姓岂能坐视！”
这天下是朱家的，大明江山要亡，朱姓之人，要担起责任，这是朱聿键给出的理由。
不过，这只是一个幌子，其实是朱聿键在经历福建之事，以及审视眼下明朝内部的状态之后，朱聿键想要借助宗亲的力量，来重新掌握朝廷和地方的军政大权。
他并非什么宗藩都用，事实上他只准备任用他的兄弟，以及臣服他的宗人。