浙江都指挥使司，决议取消家丁制度，由都指挥使司统一给士卒发饷，对于军中将领和义军首领，以及一些家丁，都造成了很大的冲击。
对于将领而言，军队的练得再好，上级一张调令，自己就给别人做了嫁衣。
因此将领都喜欢用家丁，家丁是将领的私产和家奴，上面要调动将领，军队带不走，属于私产的家丁却能带走。
如此将领们便不用担心自己的地位动摇，有精锐家丁相随，在哪里都能吃得开。
这对将领有利，所以才造成人人争先效仿，使得家丁制度，成为一个不成文的潜规则，但这样一来，将领们没心思训练军队，只顾及家丁，自然造成军队战斗力低下。
赵铭并没明确下令，说废除家丁，只是宣布以后家丁和普通士卒的饷银，都由都指挥使司统一造册发放，但这其实就是斩断了将领与家丁之间的利益关系。
果然如同马士鳌之言，军中将领大多抗拒，而不少评级为达到上等锐士的家丁，也心生不满，怀有怨恨。
赵铭对此的态度十分明确，若是不愿意接受，可以离开金塘岛，浙江都指挥使司会将他们除籍，连同家人一起送走。
一个多月的整编下来，岛上陆陆续续走了十多个将领和义军首领，以及上千精兵，并没出现不可控的局面。
赵铭决定推行，心里自是有几分底气，将领们能够养家丁，一是因为他们可以从朝廷获得饷银，二是他们占据大量的土地，自身拥有巨大的财富。
现在朝廷财政破产，将领们拿不到朝廷拨给的钱粮，而他们来到金塘岛，家财和田产显然也丢了。
这种情况下，其实将领已经拿不出钱粮给家丁发饷，而这个时候，赵铭愿意承当粮饷，便使得绝大多数家丁，都会选择留下来。
就这样，不愿意接受的人离开，愿意的人留下来，浙江都指挥使司用了一个月左右的时间，从将领手中收回了发饷的权力，并完成了士卒的平级考核。
在完成整编和考核后，自然便要开始发粮饷。
九月十五日，大晴天，入秋后天气不似夏季那么炎热，可太阳高挂，依然晒得人发昏。
此时，在太阳底下，明军士卒们却都十分兴奋，他们排成长队，不时向队伍前张望，准备领取属于自己的粮饷。
按着赵铭的规定，上等锐士每月可领一两六钱银子，下等辎兵一月能领七钱银子，另外还会发给布匹、月盐等物资。
舟山岛上，物资匮乏，饷银发下去，难免会造成物价飞涨，为了保证士卒拿到的饷银，能够保证家人的基本生存，赵铭除了发饷银外，还会发给士卒粮票。